下面内容摘录自《用R探索医药数据科学》专栏文章的部分内容(原文7310字)。

1章1节:医药数据科学的历程和发展,用R语言探索数据科学(更新20241029)-CSDN博客

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一、数据科学和临床数据科学的发展

1、认识数据科学

2、医学/临床数据科学

二、建议选择R语言的5点理由

三、初学R语言不成功的7大错误

错误1:忽视基础知识

基础知识是学习R语言的基石,但许多学习者急于进入高级阶段,常常忽视基础的学习。这种做法会导致后续学习的困难。《用R 探索医药数据科学》特别设计了系统的最基本基础课程,从数据类型、基本语法到常见的数据操作,帮助学习者夯实基础。此外,专栏提供了详细的讲解和实战演练,确保学习者能够牢牢掌握每一个基础概念,为进一步的学习打下坚实的基础。

《用R 探索医药数据科学》优势:
  • 系统的基础课程内容,涵盖数据类型、基本操作、控制结构等。
  • 配合每个基础知识点的实战案例,帮助学习者将理论应用于实践。

错误2:过分依赖教程和代码复制

依赖教程和代码示例在初学阶段可以帮助学习者快速入门,但如果一直停留在复制代码的阶段,学习者很难真正掌握编程的精髓。在我们的专栏中,每个章节不仅提供了代码示例,还深入解析了代码背后的逻辑和原理,鼓励学习者理解每一行代码的作用。通过专栏中的习题和项目实践,学习者能够逐渐减少对教程的依赖,培养独立编程的能力。

《用R 探索医药数据科学》优势:
  • 深度解析代码示例,帮助学习者理解代码原理。

错误3:忽略错误和警告信息

在编程过程中,错误和警告信息是重要的提示,能够帮助学习者定位和解决问题。然而,许多学习者往往忽略这些信息,导致问题不断积累。我们的专栏鼓励大家在每篇文章的评论区积极提问,我们会尽可能及时回复和解答。对于优秀的问题,还有机会整合成专题文章,与更多学习者分享。

《用R 探索医药数据科学》的优势:

  • 尽量提供及时的互动与解读,对大家提出的优秀问题也会择优整理成文章,让更多人共同学习和受益。

错误4:过早追求高深知识

在学习过程中,循序渐进非常重要,过早追求高深知识可能让学习者陷入困境。我们的专栏精心设计了一条从基础到高级的学习路径,帮助学习者逐步提升,夯实基础。

《用R 探索医药数据科学》的优势:

  • 循序渐进的学习路径,帮助学习者在合适的时机进阶学习。

错误5:只注重语法,不关注应用

学习 R 语言的最终目标是能够应用于实际的数据科学问题。然而,许多学习者往往过于关注语法细节,而忽视了实战应用。《用 R 探索医药数据科学》专栏通过丰富的实际案例教学,将 R 语言的基础理论与函数运用紧密结合到医药数据分析场景中,帮助学习者在解决实际问题的过程中加深理解、巩固所学。专栏还提供了多个完整的项目案例,涵盖数据清洗、探索性数据分析和建模等内容,帮助学习者更好地将理论知识应用到实践中。

《用R 探索医药数据科学》的优势:

  • 结合医药类项目的案例,覆盖数据清洗、数据分析、建模等实用内容。

错误6:学习资源过多,目标不明确

互联网资源繁多,虽然丰富,却容易让学习者眼花缭乱,分散精力,从而导致学习目标模糊。《用 R 探索医药数据科学》专栏为学习者提供系统化的学习路径,帮助明确学习方向,并逐步实现阶段性目标,助力学习者以精简代码从零起步,熟练掌握最新分析技术。

《用R 探索医药数据科学》的优势:

  • 系统化的学习路径设计,帮助学习者明确目标,以最低的学习成本实现持续成长。

错误7:害怕犯错,缺乏动手实践

编程学习需要大量的实践,但许多学习者因为害怕犯错而避免动手操作。我们的专栏特别强调实践的重要性,通过大量的练习和项目,鼓励学习者动手尝试。专栏提供了详细的代码注释和解答,帮助学习者在实践中建立自信,并学会从错误中学习。

《用R 探索医药数据科学》的优势:

  • 强调实践的重要性,提供大量练习和项目。
  • 详细的代码注释和解答,帮助学习者从错误中学习。

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 市面上的 R 语言培训班和书籍(包括网络上的文章或视频),由于受限于培训时间或书籍篇幅,往往难以深入探讨 R 语言在数据科学或人工智能中的具体应用场景,内容泛泛而谈,最终无法真正解决实际工作中的问题。同时,它们也缺乏针对医药领域的深度结合与讨论。为了解决这些痛点,我们推出了《用 R 探索医药数据科学》专栏。该专栏将持续更新,不仅为您提供系统化的学习内容,更致力于成为您掌握最新、最全医药数据科学技术的得力助手。

  •  每篇文章篇幅在5000字 至9000字之间。
  • 内容涵盖试验统计、预测模型、科研绘图、数据库、机器学习等热点领域。

《用 R 探索医药数据科学》专栏目录(截止11月份23日)

第一章:认识数据科学和R

1章1节:医药数据科学的历程和发展,用R语言探索数据科学(更新20241029)-CSDN博客

1章2节:机器学习、统计学与ChatGPT的概述,与R语言的相关 (更新20241229)_ai、chatgpt和机器学习什么关系-CSDN博客

1章3节:R 语言的产生与发展轨迹(更新2024/08/14)-CSDN博客

1章4节:数据可视化, R 语言的静态绘图和 Shiny 的交互可视化演示(更新20240814)-CSDN博客

第二章:R的安装和数据读取

2章1节:R和RStudio的下载和安装(Windows 和 Mac)-CSDN博客

2章2节:RStudio 四大区应用全解,兼谈 R 的代码规范与相关文件展示_rstudio的console和terminal-CSDN博客

2章3节:RStudio的高效使用技巧,自定义RStudio环境(更新20241023)_rstudio如何使用-CSDN博客

2章4节:用RStudio做项目管理,静态图和动态图的演示,感受ggplot2的魅力-CSDN博客

2章5节:详解R的扩展包管理(从模糊安装到自动更新)及工作目录和工作空间的设置(更新20241030 )-CSDN博客

2章6节:R的数据集读取和利用,如何高效地直接复制黏贴数据到R(20240807 )_r语言 复制数据集-CSDN博客

2章7节:读写RDS,CSV,TXT,Excel,SPSS、SAS、Stata、Minitab等的数据文件(更新20240807)_r语言读取rds文件-CSDN博客

2章8节:一文学会 R Markdown 的文档核心操作,切记文末有R资源的分享_r markdown文件(.rmd)-CSDN博客

2章9节:在R中应用SQL语言(更新20241217)-CSDN博客

2章10节:R的网络爬虫技术快速入门(更新20241217)-CSDN博客

第三章:认识数据

3章1节:数据的基本概念以及 R 中的数据结构、向量与矩阵的创建及运算-CSDN博客

3章2节:继续讲R的数据结构,数组、数据框和列表-CSDN博客

3章3节:R的赋值操作与算术运算_r里面的赋值-CSDN博客

3章4节:R的逻辑运算和矩阵运算-CSDN博客

3章5节:R 语言的循环与遍历函数全解析-CSDN博客

第四章:数据的预处理

4章1节:全面了解 R 中的数据预处理,通过 R 基本函数实施数据查阅_r数据预处理-CSDN博客

4章2节:从排序到分组和筛选,通过 R 的 dplyr 扩展包来操作-CSDN博客

4章3节:处理医学类原始数据的重要技巧,R语言中的宽长数据转换,tidyr包的使用指南-CSDN博客

4章4节:临床数据科学中如何用R来进行缺失值的处理_临床生存分析缺失值r语言-CSDN博客

4章5节:数据科学中的缺失值的处理,删除和填补的选择,K最近邻填补法-CSDN博客

4章6节:R的多重填补法中随机回归填补法的应用,MICE包的实际应用和统计与可视化评估-CSDN博客

4章7节:用R做数据重塑,数据去重和数据的匹配-CSDN博客

4章8节:用R做数据重塑,行列命名和数据类型转换-CSDN博客

4章9节:用R做数据重塑,增加变量和赋值修改,和mutate()函数的复杂用法_r语言如何在数据集中添加变量-CSDN博客

4章10节:用R做数据重塑,变体函数应用详解和可视化的数据预处理介绍-CSDN博客

4章11节:用R做数据重塑,数据的特征缩放和特征可视化-CSDN博客

4章12节:R语言中字符串的处理,正则表达式的基础要点和特殊字符-CSDN博客

4章13节:R语言中Stringr扩展包进行字符串的查阅、大小转换和排序-CSDN博客

4章14节:R语言中字符串的处理,提取替换,分割连接和填充插值_r语言替换字符串-CSDN博客

4章15节:字符串处理,提取匹配的相关操作扩展,和Stringr包不同函数的重点介绍和举例-CSDN博客

4章16节:R 语言中日期时间数据的关键处理要点_r语言 时刻数据-CSDN博客

第五章:定量数据的统计描述

5章1节:用R语言进行定量数据的统计描述,文末有众数的自定义函数-CSDN博客

5章2节:离散趋势的描述,文末1个简单函数同时搞定20个结果-CSDN博客

5章3节:在R语言中,从实际应用的角度认识假设检验-CSDN博客

5章4节:从R语言的角度认识正态分布与正态性检验-CSDN博客

5章5节:认识方差和方差齐性检验(三种方法全覆盖)-CSDN博客

5章6节:R语言中的t检验,独立样本的t检验-CSDN博客

5章7节:单样本t检验和配对t检验-CSDN博客

5章8节:方差分析(ANOVA)及其应用-CSDN博客

5章9节:组间差异的非参数检验,Wilcoxon秩和检验和Kruskal-Wallis检验-CSDN博客

第六章:定性数据的统计描述 

6章1节:定性数据的统计描述之列联表,文末有优势比计算介绍-CSDN博客

6章2节:认识birthwt数据集,EpiDisplay和Gmodels扩展包的应用-CSDN博客

6章3节:独立性检验,卡方检验,费希尔精确概率检验和Cochran-Mantel-Haenszel检验-CSDN博客

6章4节:相关关系和连续型变量的Pearson相关分析-CSDN博客

6章5节:分类型变量的Spearman相关分析,偏相关分析和相关图分析-CSDN博客

6章6节:相关图的GGally扩展包,和制表的Tableone扩展包-CSDN博客

第七章:R的传统绘图

7章1节:认识R的传统绘图系统,深度解析plot()函数和par()函数的使用-CSDN博客

7章2节:R基础绘图之散点图、直方图和概率密度图-CSDN博客

7章3节:R基础绘图之条形图和堆积条形图-CSDN博客

7章4节:饼图,箱线图和克利夫兰点图-CSDN博客

7章5节:R基础绘图之Cleveland 点图,马赛克图和等高图(更新20250102)_散点矩阵图-CSDN博客

​​​​​​​7章6节:用R进行图形的保存与导出,详细的高级图形输出,一文囊括大多数保存的各种问题,和如何批量保存不同情况的图形-CSDN博客

 

第八章:R的进阶绘图

8章1节:认识 ggplot2 扩展包,深度解析 qplot() 函数的使用-CSDN博客

8章2节:ggplot2绘图之原理逻辑分解,掌握绘图步骤(更新20241104)-CSDN博客

8章3节:ggplot2绘图之内置主题设置全解析(更新20241104)-CSDN博客

8章4节:ggplot2绘图之几何体解析(一),参考线和基准线与分布图和频数图(更新20241104)-CSDN博客

8章5节:ggplot2绘图之几何体解析(二),关系图和时间序列图与误差条和高级图形平滑曲线(更新20241104)-CSDN博客

8章6节:坐标轴须图和带状图(更新20241107)_维恩图 约翰·维恩-CSDN博客

8章7节:深度解析如何绘制多样的小提琴图(更新20241231)-CSDN博客

8章8节:雷达图和RadViz图-CSDN博客

8章9节:词云图和树图(更新20241106)_echarts 可以生成词云图吗-CSDN博客

8章10节:维恩图和UpSet图_ae做柱状图动态图-CSDN博客

8章11节:R的地理图绘制(更新20241104)-CSDN博客

8章12节:三维图,由三维散点图起步,引入回归模型平面,到复杂坐标和渐变色的三维曲面图(更新20241107)-CSDN博客

8章13节:网络图(知识图谱)绘制的深度解析(更新20241109)-CSDN博客

8章14节:高质量动态图和交互式动态图

8章15节:让 ggplot2 绘图进行顶级科研杂志的配色(更新20241118) 

8章16节:个性化配色的自定义颜色演示

8章17节:轻便科研绘图的tidyplots扩展包

第九章:临床试验的统计 

9章1节:初步认识临床试验(约7500字)-CSDN博客

9章2节:样本量估计的初步介绍-CSDN博客

9章3节:用R进行样本量估计的统计学参数-CSDN博客

9章4节:两组例数相同的均数比较的样本量估计和绘制功效曲线-CSDN博客

9章5节:两组的例数不等的均数比较的样本量估计和可视化-CSDN博客

9章6节:自身配对设计的均数比较临床试验的样本量估计和可视化-CSDN博客

9章7节:与总体均数比较的样本量估计和可视化-CSDN博客

9章8节: 两、三组试验组率比较的样本量估算和可视化-CSDN博客

9章9节:试验的随机分组认识,用R做简单随机化-CSDN博客

9章10节:用R实现分层随机化-CSDN博客

9章11节:用R实现区组随机化和置换区组随机化-CSDN博客

9章12节:动态随机化方法介绍,和用R绘制随机化卡片-CSDN博客

第十章:Meta分析攻略

10章1节:认识循证医学中的Meta分析,并予代码演示分析绘图-CSDN博客

​​10章2节:Meta分析的7大步骤的扼要解读-CSDN博客

10章3节:二分类变量的Meta分析模型,分析公式构建和结果解读-CSDN博客

10章4节:二分类变量的Meta分析模型,绘制漏斗图和应用剪补法,最后绘制和解读轮廓增强漏斗图-CSDN博客

10章5节:二分类变量的Meta分析模型,敏感性分析和亚组分析,绘制森林图-CSDN博客

10章6节:连续型变量的Meta分析和可视化分析全解-CSDN博客

10章7节:用R进行单个率Meta分析-CSDN博客

10章8节:用R进行网状Meta分析细解-CSDN博客

第十一章:主成分分析

11章1节:深度讲解用R进行主成分分析(上)-CSDN博客

11章2节:​深度讲解用R进行主成分分析(中)-CSDN博客

11章3节:​深度讲解用R进行主成分分析(下)-CSDN博客

11章4节:学会用R进行因子分析(上)-CSDN博客  

11章5节:学会用R进行因子分析(中)-CSDN博客

11章6节:学会用R进行因子分析(下)-CSDN博客

第十二章:常见类型回归分析

12章1节:认识回归分析的历史背景及应用-CSDN博客

12章2节:构建一元和多元的线性回归模型-CSDN博客

12章3节:回归模型中哑变量的应用和设置-CSDN博客

12章4节:深度解读构建回归模型表达式的九个关键符号-CSDN博客

12章5节:深度剖析回归模型结果的相关函数-CSDN博客

12章6节:深度解读线性回归模型的绘图判断-CSDN博客

12章7节:构建因变量为分类变量的二分类Logistic回归模型-CSDN博客

12章8节:详解不同逻辑回归模型的比较,和如何进行变量优化-CSDN博客

12章9节:深度讲解有序多分类Logistic回归模型的分析-CSDN博客

12章10节:条件Logistic回归模型的分析-CSDN博客

第十三章:生存分析模型

13章1节:生存分析的基本概念和主要内容-CSDN博客

13章2节:用R进行生存率的描述与估计-CSDN博客

13章3节:生存分析的假设检验及可视化展示-CSDN博客

13章4节:认识比例风险模型和Cox比例风险模型,学会从协变量的调整选择最优模型-CSDN博客

13章5节:用逐步回归方法来选择模型协变量,比例风险假定的检验和森林图的绘制-CSDN博客

第十四章:匹配技术应用

14章1节:认识临床研究的匹配技术-CSDN博客

14章2节:匹配结果的可视化和匹配后新数据分析-CSDN博客

第十五章:判别和聚类分析

15章1节:医学研究中的判别分析和聚类分析-CSDN博客

15章2节:线性判别分析预测模型构建评估和可视化演示-CSDN博客

15章3节:二次判别分析技术的运用-CSDN博客

15章4节:K-Means聚类分析的运用,和改进算法的K-Means++-CSDN博客

15章5节:实现k-medoids聚类算法的PAM和CLARA方法-CSDN博客

15章6节:凝聚层次聚类和分裂层次聚类-CSDN博客

第十六章:机器学习入门 

16章1节:机器学习和人工智能的基础知识-CSDN博客

16章2节:机器学习在临床预测中的应用场景,与临床预测模型的关键步骤解析-CSDN博客

16章3节:详析训练数据集、测试数据集和验证数据集及其划分策略-CSDN博客

16章4节:采用随机抽样法和等比抽样法对数据集进行二份及三份的划分-CSDN博客

16章5节:划分数据的多次随机抽样的Bootstrap法和加权随机抽样法-CSDN博客

16章6节:交叉验证概述与分类,R中K折交叉验证的详细解析-CSDN博客

16章7节:机器学习算法解读,与数值预测回归模型构建-CSDN博客

16章8节:朴素贝叶斯分类预测模型,从构建、解析到实战-CSDN博客

16章9节:认识决策树,构建CART算法的决策树模型-CSDN博客

16章10节:深度解析如何构建随机森林算法预测模型-CSDN博客

16章11节:构建人工神经网络反向传播算法预测模型-CSDN博客

16章12节:认识机器学习的模型评估,掌握数值型数据的模型评估方法-CSDN博客

16章13节:分类模型的混淆矩阵评估-CSDN博客

16章14节:评估和对比预测模型的ROC曲线和AUC值-CSDN博客

16章15节:六大ROC曲线扩展包的对比,和其它评估曲线的绘制-CSDN博客

第十七章:文献计量学 

17章1节:文献计量分析基础-CSDN博客

17章2节:文献计量学的国外数据库的数据采集,WOS数据库和PUBMED数据库的文献信息批量下载和分析

17章3节:国际六大科研文献数据库的数据加载与格式转换解析

17章4节:文献计量学中数据合并、去重、切片与编辑 

17章5节:文献计量学的描述性分析

17章6节:文献计量学的可视化与引文信息分析

17章7节:作者主导性分析及H指数与其变体的应用 

17章8节:Lotka分析和知识单元时序分析

17章9节:局部被引次数分析与文献文本字段术语提取研究

17章10节:为构建网络图从文献数据中提取特定信息-CSDN博客

17章11节:文献计量分析合作情况可视化-CSDN博客

17章12节:耦合网络可视化,从常规网络图到耦合分析聚类图的深度讲解-CSDN博客

17章13节:共被引网络、历史共被引网络和共词网络的可视化-CSDN博客

​​17章14节:概念结构图,贡献度最高文献因子图和最被引用文献因子图-CSDN博客

 17章15节:文献计量学的语义地图和主题演化分析图-CSDN博客

17章16节:PubMed数据库的数据提取和可视化-CSDN博客

17章17节:文献计量中著作层面的情感分析-CSDN博客

第十八章:时间序列分析

18章1节:认识时间序列分析,创建和整理时间序列数据-CSDN博客

18章2节:深度讲解白噪音检验-CSDN博客

18章3节:认识ARIMA模型和模拟其数据,讲解平稳性检验-CSDN博客

18章4节:ACF和PACF的可视化,和识别最佳模型-CSDN博客

18章5节:如何应用SARIMA模型来进行时间序列数据的预测-CSDN博客

18章6节:Facebook 的时间序列预测的 Prophet 模型-CSDN博客

第十九章:NHANES数据库

19章1节:认识二次数据分析和NHANES数据库-CSDN博客

19章2节:下载NHANES数据并使用R进行读取-CSDN博客

19章3节:NHANES数据的下载读取、追加和合并-CSDN博客

19章4节:NHANES的抽样权重、方差估计和估计值评估-CSDN博客

19章5节:处理NHANES数据的options和svydesign函数-CSDN博客

19章5节:处理NHANES数据的options和svydesign函数-CSDN博客

19章6节:复现NHANES的美国成人抑郁症患病率研究(上)-CSDN博客

19章7节:复现NHANES的美国成人抑郁症患病率研究(中)-CSDN博客

19章8节:复现NHANES的美国成人抑郁症患病率研究(下)-CSDN博客

19章9节:一步一步构建高效读取NHANES数据的自定义函数-CSDN博客

19章10节:如何解决 NHANES 数据合并所遇原表差异问题-CSDN博客

 第二十章:gglot2扩张包

20章1节:模型系数图、相关矩阵图、双变量成对矩阵图-CSDN博客

20章2节:绘制网络对象图和叠加地图网络图-CSDN博客

20章3节:绘制平行坐标图和模型诊断图-CSDN博客

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