Cell|虚拟细胞难以复刻AlphaFold成功?
摘要
生成式人工智能(Gen‑AI)在多项生物学研究领域表现亮眼,涵盖蛋白质折叠、从头蛋白设计、致病突变预测。但这些分子层面的成功,能否拓展至免疫学、肿瘤学、神经退行性疾病等领域的细胞与多细胞层面研究,目前尚不明确。造成该局面的原因包括:决定细胞与生命体行为的分子机制错综复杂、高质量训练数据不足、绝大多数病理表型具备多细胞属性。亟需全新的生成式AI框架,将分子互作网络等已有生物学先验知识整合进来,同时提炼研究纲领,引导学界聚焦具备生物学价值、具备转化潜力的科学问题。借鉴希尔伯特23个数学难题(该纲领指引数学界1个多世纪的研究方向),本文提出15项重大AI挑战,用以引导生物医学领域研究者重点关注1批关键科学问题,其中绝大多数问题目前仍缺少有效的预测方法。
ac2248@cumc.columbia.edu
#生成式AI #细胞生物学 #基础大模型 #虚拟细胞 #多尺度建模 #细胞扰动 #多组学 #反事实仿真 #生物基准测试 #多细胞系统
塑造生物学生成式AI未来的15大挑战

图1 15项生成式AI生物学挑战:从分子互做到临床转化
面向生成式AI研究社区的15项生物学挑战。
挑战按照建模目标分层组织:
(1) 分子互作(绿色);
(2) 分子功能(蓝色);
(3) 细胞/系统功能(紫红色);
(4) 转化应用(橙色)。
中心:基础模型,在扰动数据与分子互作模型上训练。
表1 15项挑战对应的概念验证基准示例



详细总结

思维导图
mindmap脑图
论文信息

Level1:分子互作
Molecular‑level interactions

Level2:分子功能
Molecular function

Level3:细胞/系统功能
Cellular/systems function

Level4:临床转化
Translation

参考
Cell. 2026 Aug 17:S0092-8674(26)00802-0. doi: 10.1016/j.cell.2026.07.004.
Fifteen challenges for generative AI applications to cell biology
注:AI辅助创作,如有不当欢迎指出。内容仅供参考,不构成任何建议。
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